Helmer, Dorothea - Synthesis and Test of Peptides and Peptoids
Schrijver: | Helmer, Dorothea |
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Titel: | Synthesis and Test of Peptides and Peptoids for the Inhibition of Cytokines |
ISBN: | 9783954049844 |
Taal: | Engels |
Uitgever: | Cuvillier Verlag |
Bijzonderheden: | 2015 206pp Paperback / softback |
Prijs: | € 60,60 |
Verzendkosten: | Gratis (binnen Nederland) |
Meer info: |
Annotatie Die vorliegende Arbeit beschreibt die Identifizierung und Charakterisierung von Chemokin-bindenden Strukturen aus der Klasse der Peptide und Peptoide. Im ersten Teil wurde durch flexibles Protein-Protein Docking ein Modell des Rezeptor-Ligand-Komplexes des Chemokins CXCL8 mit seinem Rezeptor CXCR1 e Flaptekst Die vorliegende Arbeit beschreibt die Identifizierung und Charakterisierung von Chemokin-bindenden Strukturen aus der Klasse der Peptide und Peptoide. Im ersten Teil wurde durch flexibles Protein-Protein Docking ein Modell des Rezeptor-Ligand-Komplexes des Chemokins CXCL8 mit seinem Rezeptor CXCR1 entwickelt, welches die in der Literatur vorgeschlagene Möglichkeit einer Wechselwirkung zwischen dem ELR Motiv von CXCL8 und den extrazellulären Domänen von CXCR1 bestätigt. Auf der Basis dieses Modells wurde durch Verknüpfung von zwei Ausschnitten aus der Sequenz von CXCR1 ein Peptid entworfen, welches CXCL8 mit einer Affinität von 500 nM bindet und die durch CXCL8 induzierte Migration von humanen neutrophilen Granulozyten inhibiert. Im zweiten Teil der Arbeit wurden one-bead-one-compound (OBOC) Bibliotheken von Peptoiden auf TentaGel Harz systematisch auf ihre Fähigkeit zur Bindung an fluoreszenzmarkiertes CXCL8 untersucht. Durch Optimierung der Screening-Parameter und Vereinfachung des Auswertungsprozesses mittels Analyse von fluoreszenzmikroskopisch erhaltenen Mischkanalbildern wurden 18 Peptoidsequenzen identifiziert, die CXCL8 mit mikromolaren Affinitäten binden. |
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